При проведении реализации нерезиденту нужно ли выписывать ЭСФ

Согласно пункту 1 статьи 412 НК РК,  При совершении оборота по реализации товаров, работ, услуг обязаны выписать счет-фактуру плательщики налога на добавленную стоимость, предусмотренные подпунктом 1) пункта 1 статьи 367 настоящего Кодекса;

Если вы плательщик НДС то ЭСФ вы выписывать обязаны при оказании услуг нерезиденту.

У вас логистические услуги и вы пишете в вопросе, что вы экспедиторская компания.